78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1827 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  100 
 
 
802 aa  1639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  50.58 
 
 
522 aa  332  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  53.93 
 
 
644 aa  312  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  48.46 
 
 
542 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  47.41 
 
 
690 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  36.92 
 
 
781 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  38.41 
 
 
638 aa  208  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  39.21 
 
 
524 aa  198  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  46.6 
 
 
660 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  37.9 
 
 
514 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  43.78 
 
 
585 aa  181  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  43.75 
 
 
514 aa  180  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  40.41 
 
 
551 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  46.95 
 
 
509 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  41.88 
 
 
518 aa  177  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  41.15 
 
 
521 aa  177  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  43.46 
 
 
544 aa  177  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  45.19 
 
 
521 aa  170  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  44.71 
 
 
521 aa  170  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  40.93 
 
 
512 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  37.14 
 
 
401 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  42.06 
 
 
405 aa  168  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  39.74 
 
 
1117 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  39.42 
 
 
522 aa  164  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  43.06 
 
 
521 aa  163  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  43.27 
 
 
522 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  41.63 
 
 
569 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  46.03 
 
 
724 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  38.87 
 
 
522 aa  157  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  37.8 
 
 
596 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  42.86 
 
 
405 aa  156  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  37.8 
 
 
599 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  36.19 
 
 
821 aa  150  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  39.68 
 
 
649 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  36.71 
 
 
470 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  39.2 
 
 
465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  31.87 
 
 
394 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  37.17 
 
 
500 aa  127  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  34.78 
 
 
585 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  37.97 
 
 
700 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  38.3 
 
 
697 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  34.16 
 
 
497 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  37.37 
 
 
498 aa  119  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  37.5 
 
 
478 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  33 
 
 
517 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  29.71 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  29.71 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  29.71 
 
 
509 aa  112  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  31.17 
 
 
522 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.42 
 
 
740 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  34.16 
 
 
517 aa  107  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  34.3 
 
 
402 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.42 
 
 
740 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  32.98 
 
 
734 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  36.46 
 
 
479 aa  104  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  32.18 
 
 
686 aa  95.1  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  29.84 
 
 
499 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  29.84 
 
 
499 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  29.69 
 
 
474 aa  60.8  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  29.7 
 
 
400 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  26.72 
 
 
392 aa  60.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  26.72 
 
 
392 aa  60.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  26.61 
 
 
392 aa  58.9  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  29.06 
 
 
405 aa  56.2  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  27.96 
 
 
501 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  26.86 
 
 
386 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  23.9 
 
 
485 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  27.16 
 
 
386 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  24.86 
 
 
391 aa  52.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  27.31 
 
 
389 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  26.86 
 
 
388 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  28.41 
 
 
387 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  26.56 
 
 
388 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  27.39 
 
 
388 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  24.6 
 
 
475 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  25.12 
 
 
475 aa  46.6  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  27.98 
 
 
396 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2515  hypothetical protein  21.63 
 
 
518 aa  44.3  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>