63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1502 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 
141 aa  276  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  92.2 
 
 
141 aa  260  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  61.7 
 
 
141 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  51.77 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4258  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.51 
 
 
136 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000634624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  54.61 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  54.61 
 
 
141 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.19 
 
 
141 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  30.5 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.57 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  35.82 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.75 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.88 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  31.88 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.71 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.09 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.59 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 
162 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3136  F0F1-type ATP synthase, subunit B  27.66 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.86 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0944  putative F0F1-type ATP synthase  27.66 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.360039  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  29.86 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  29.86 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  31.4 
 
 
247 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  32.98 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  30.5 
 
 
253 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.15 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.6 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  32.39 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  26.39 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  27.86 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  27.86 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  25.38 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.81 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.03 
 
 
158 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.59 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.59 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  29.93 
 
 
248 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  32.35 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.6 
 
 
259 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 
156 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 
156 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  25.69 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  29.5 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.03 
 
 
270 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  26.47 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
195 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  31.25 
 
 
264 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  29.76 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  31.34 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.17 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  28.97 
 
 
278 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  27.83 
 
 
177 aa  40.4  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  25.17 
 
 
156 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.65 
 
 
152 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>