79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1205 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1205  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3512  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0582986  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2802  hypothetical protein  45.07 
 
 
219 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236486  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3274  iron-sulfur cluster-binding protein  44.34 
 
 
220 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1616  iron-sulfur cluster-binding protein  41.2 
 
 
228 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4908  hypothetical protein  40.72 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3188  ferredoxin  38.32 
 
 
588 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.32 
 
 
562 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  38.32 
 
 
599 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1070  AIG2 family protein  29.52 
 
 
330 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  28.11 
 
 
376 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  27.27 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  25.85 
 
 
360 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  24.88 
 
 
400 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  31.03 
 
 
278 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1635  methionine aminopeptidase, type I  26.06 
 
 
289 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.092319  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  30.14 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1642  methionine aminopeptidase  28.46 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2012  methionine aminopeptidase  28.46 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  29.86 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  24.87 
 
 
371 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1823  methionine aminopeptidase  28.46 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  29.86 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1375  methionine aminopeptidase, type I  25.45 
 
 
289 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0048562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3650  hypothetical protein  27.5 
 
 
298 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680821  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0287  methionine aminopeptidase, type I  22.75 
 
 
257 aa  45.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000363229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8732  hypothetical protein  28.78 
 
 
297 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13404  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  28.36 
 
 
268 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  29.85 
 
 
265 aa  45.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  28.36 
 
 
268 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  28.36 
 
 
268 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  28.36 
 
 
268 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  27.1 
 
 
359 aa  45.1  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0562  methionine aminopeptidase, type I  27.17 
 
 
263 aa  45.1  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.76 
 
 
359 aa  45.1  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  22.63 
 
 
353 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  24.85 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  29.3 
 
 
353 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  29.3 
 
 
353 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  25.6 
 
 
287 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  25.55 
 
 
371 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  29.17 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  26.06 
 
 
266 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  29.85 
 
 
266 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  23.7 
 
 
265 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1797  hypothetical protein  25.5 
 
 
291 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  24.32 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1294  hypothetical protein  24.8 
 
 
291 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00319958  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  24.34 
 
 
285 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  25.58 
 
 
374 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10020  methionine aminopeptidase, type I  26.56 
 
 
285 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  28.32 
 
 
388 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  28.32 
 
 
388 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  23.93 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  25.9 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3399  hypothetical protein  27.08 
 
 
299 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  23.73 
 
 
279 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5318  hypothetical protein  27.08 
 
 
299 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0966148  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  25.9 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4968  hypothetical protein  27.08 
 
 
299 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  26.15 
 
 
264 aa  42  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  25 
 
 
287 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  22.22 
 
 
248 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  22.22 
 
 
248 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  22.22 
 
 
248 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  22.22 
 
 
248 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  24.7 
 
 
265 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  22.22 
 
 
366 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0710  hypothetical protein  27.92 
 
 
299 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871077  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  22.22 
 
 
248 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1358  hypothetical protein  26.45 
 
 
291 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4909  hypothetical protein  27.08 
 
 
298 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  22.22 
 
 
248 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4390  hypothetical protein  27.08 
 
 
327 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21060  hypothetical protein  24.22 
 
 
291 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829076  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  22.22 
 
 
248 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  24.86 
 
 
351 aa  41.6  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  30.41 
 
 
248 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1412  methionine aminopeptidase type I  24.34 
 
 
298 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>