20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1294 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1294  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00319958  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1358  hypothetical protein  96.03 
 
 		 291 aa  547  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0710  hypothetical protein  78.6 
 
 		 299 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3399  hypothetical protein  77.62 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4968  hypothetical protein  77.62 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3650  hypothetical protein  78.45 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5318  hypothetical protein  77.27 
 
 		 299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0966148  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0914  hypothetical protein  74.22 
 
 		 295 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1807  hypothetical protein  72.88 
 
 		 295 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4909  hypothetical protein  79.06 
 
 		 298 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4390  hypothetical protein  79.78 
 
 		 327 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0821  hypothetical protein  75.27 
 
 		 295 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21060  hypothetical protein  61.37 
 
 		 291 aa  361  9e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1797  hypothetical protein  60.43 
 
 		 291 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8732  hypothetical protein  46.34 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13404  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  25.93 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  23.57 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  23.48 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  23.48 
 
 		 351 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1205  hypothetical protein  24.8 
 
 		 221 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>