55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8732 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8732  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  607  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13404  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1797  hypothetical protein  49.83 
 
 
291 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21060  hypothetical protein  49.83 
 
 
291 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829076  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3650  hypothetical protein  47.81 
 
 
298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680821  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0710  hypothetical protein  47.47 
 
 
299 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871077  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3399  hypothetical protein  47.47 
 
 
299 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540899  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5318  hypothetical protein  47.47 
 
 
299 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0966148  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4968  hypothetical protein  47.47 
 
 
299 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0914  hypothetical protein  47.99 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1807  hypothetical protein  48.29 
 
 
295 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15946  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1358  hypothetical protein  45.94 
 
 
291 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1294  hypothetical protein  45.58 
 
 
291 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00319958  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0821  hypothetical protein  47.99 
 
 
295 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4390  hypothetical protein  47.75 
 
 
327 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4909  hypothetical protein  47.75 
 
 
298 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  25.81 
 
 
356 aa  53.9  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.58 
 
 
351 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.58 
 
 
351 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  25.99 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  23.93 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  31.64 
 
 
366 aa  49.3  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.73 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  23.88 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  26.11 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  29.94 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  24.38 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  24.38 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  26.35 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1634  peptidase M24  35.35 
 
 
393 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.712071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  26.36 
 
 
359 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  31.32 
 
 
364 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  25.32 
 
 
249 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  25.28 
 
 
366 aa  46.2  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  23.53 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  28.42 
 
 
347 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  26.11 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1205  hypothetical protein  28.78 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  23.6 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  23.16 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0754  methionine aminopeptidase, type II  22.42 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.326379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  24.31 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.04 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  24.57 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  23.26 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  24.73 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  25 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  32.12 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  28.57 
 
 
371 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  28.48 
 
 
357 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  23.53 
 
 
268 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  28.07 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  24.71 
 
 
262 aa  42.7  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  25.97 
 
 
357 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0731  peptidase M24  27.88 
 
 
352 aa  42.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000317312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  27.97 
 
 
260 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>