25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_21060  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829076  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1797  hypothetical protein  95.19 
 
 
291 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0914  hypothetical protein  63.74 
 
 
295 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1807  hypothetical protein  63.6 
 
 
295 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0710  hypothetical protein  62.5 
 
 
299 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871077  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3650  hypothetical protein  62.68 
 
 
298 aa  349  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680821  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1358  hypothetical protein  61.28 
 
 
291 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5318  hypothetical protein  61.76 
 
 
299 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0966148  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3399  hypothetical protein  61.76 
 
 
299 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4968  hypothetical protein  61.76 
 
 
299 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1294  hypothetical protein  61.28 
 
 
291 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00319958  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0821  hypothetical protein  63.74 
 
 
295 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4390  hypothetical protein  62.08 
 
 
327 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4909  hypothetical protein  62.03 
 
 
298 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8732  hypothetical protein  49.83 
 
 
297 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13404  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  26.45 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  26.45 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  26.45 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  26.45 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  26.45 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  26.45 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  26.45 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0731  peptidase M24  24.56 
 
 
352 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000317312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  25.62 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  25.62 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>