225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1700 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  100 
 
 
490 aa  1023    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  60.85 
 
 
501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  59.87 
 
 
486 aa  519  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2085  alkaline phosphatase  59.31 
 
 
491 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419871  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0512  Alkaline phosphatase  50.51 
 
 
501 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.239781  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2225  Alkaline phosphatase  51.68 
 
 
481 aa  457  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  53.2 
 
 
481 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  41.86 
 
 
487 aa  352  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  45.41 
 
 
494 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0930  Alkaline phosphatase  40.71 
 
 
537 aa  309  9e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  37.28 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0924  Alkaline phosphatase  38 
 
 
527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000229427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  32.89 
 
 
434 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  32.58 
 
 
434 aa  193  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  31.17 
 
 
455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  32.81 
 
 
436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  32.25 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  34.22 
 
 
445 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  30.04 
 
 
455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  28.12 
 
 
474 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  28.12 
 
 
474 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  31.97 
 
 
439 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  27.54 
 
 
536 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  31.97 
 
 
425 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  31.76 
 
 
439 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  31.76 
 
 
439 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  30.82 
 
 
440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  27.85 
 
 
433 aa  157  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  30.77 
 
 
457 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  28.34 
 
 
477 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  28.1 
 
 
557 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  28.45 
 
 
557 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  31.75 
 
 
492 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  28.01 
 
 
557 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  28.25 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  28.25 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  28.51 
 
 
547 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  28.29 
 
 
454 aa  146  8.000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  27.93 
 
 
489 aa  146  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  30.7 
 
 
476 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  28.69 
 
 
557 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  31.92 
 
 
454 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  30.23 
 
 
543 aa  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  28.6 
 
 
464 aa  143  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  29.02 
 
 
461 aa  143  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  30.89 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  30.89 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  30.89 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  27.14 
 
 
553 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  29.86 
 
 
461 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  29.28 
 
 
480 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  28.89 
 
 
461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  28.69 
 
 
461 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  28.3 
 
 
548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  28.69 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  28.69 
 
 
461 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  28.28 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  28.28 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  27.66 
 
 
557 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  28.48 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  26.98 
 
 
557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  26.42 
 
 
506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  28.48 
 
 
461 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  28.48 
 
 
461 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  28.04 
 
 
557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1383  Alkaline phosphatase  36.33 
 
 
608 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  29.28 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  32.67 
 
 
610 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0192  alkaline phosphatase  28.71 
 
 
400 aa  127  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.282333  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  30.48 
 
 
488 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  25.55 
 
 
606 aa  126  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  28.32 
 
 
429 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  27.81 
 
 
518 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  30.37 
 
 
525 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  30.35 
 
 
450 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  32.82 
 
 
467 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  27.37 
 
 
582 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3187  alkaline phosphatase  27.16 
 
 
468 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  28.26 
 
 
589 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  30.11 
 
 
525 aa  123  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0399  Alkaline phosphatase  26.64 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  25.83 
 
 
541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  28.6 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0870  Alkaline phosphatase  33.87 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  32.34 
 
 
607 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  27.59 
 
 
584 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  29.62 
 
 
335 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  31.06 
 
 
464 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  29.61 
 
 
480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  32.91 
 
 
671 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  26.24 
 
 
585 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  28.15 
 
 
581 aa  114  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  31.71 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
505 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  30.75 
 
 
464 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  28.63 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  30.24 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  26.39 
 
 
589 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  28.16 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  28.42 
 
 
467 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>