More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1578 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  85.88 
 
 		 443 aa  746    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  100 
 
 		 441 aa  879    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  62.81 
 
 		 460 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  52.36 
 
 		 455 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  54.57 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  52.13 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  51.91 
 
 		 455 aa  448  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  52.13 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  51.91 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  51.91 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  51.91 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  51.91 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  51.69 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  51.46 
 
 		 455 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  52.04 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  52.86 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  54.61 
 
 		 445 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  55.16 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  51.68 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  53.29 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  49.66 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  51.45 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  49.78 
 
 		 456 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  49.55 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  49.33 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  51.13 
 
 		 463 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  49.1 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  49.89 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  52.5 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  48.22 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  50.22 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  47.95 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  48.78 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  51.13 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  48.18 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  48.88 
 
 		 458 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  47.73 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  48.18 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  50.22 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  48.64 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  49.78 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  51.35 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  48.79 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1002  amino acid carrier protein  49.13 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.663557  normal  0.482987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  47.95 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  50 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  51.95 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  49.33 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  48.44 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  49.78 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  47.94 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  48.67 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  51.72 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  48.67 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  47.5 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  47.5 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  47.05 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  48.79 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  48.67 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  47.5 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  47.68 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  47.5 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  49.55 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  48.67 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  53.27 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  51.69 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  51.37 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  50.55 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  48.21 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  48.42 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07220  amino acid carrier protein  48.79 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.825917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  48.53 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  43.9 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  49.23 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  49.76 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  49.12 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  47.32 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  50.83 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  45.74 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  47.98 
 
 		 464 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  47.98 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  47.1 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  48.66 
 
 		 447 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  48 
 
 		 459 aa  362  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  50.23 
 
 		 460 aa  362  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  53.14 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  51.54 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  48.76 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  48.35 
 
 		 487 aa  349  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  42.39 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0373  amino acid carrier protein  43.07 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  44.49 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  45.28 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  45.54 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  45.81 
 
 		 492 aa  339  5e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  42.51 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0673  amino acid carrier protein  40.64 
 
 		 470 aa  333  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000329208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  45.2 
 
 		 490 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  45.45 
 
 		 464 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  44.49 
 
 		 456 aa  329  7e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>