More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1264 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  71.29 
 
 		 511 aa  758    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  63.41 
 
 		 493 aa  654    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  74.95 
 
 		 506 aa  779    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  75.66 
 
 		 503 aa  769    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  76 
 
 		 505 aa  803    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1264  cobyric acid synthase  100 
 
 		 503 aa  1033    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1516  cobyric acid synthase  62.8 
 
 		 495 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0172063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.51 
 
 		 772 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  46.41 
 
 		 787 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.49 
 
 		 776 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  45.02 
 
 		 797 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  45.51 
 
 		 498 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  44.02 
 
 		 532 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  42.83 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  44.72 
 
 		 481 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  43.67 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  43.88 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  45.21 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  45.81 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.25 
 
 		 777 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  43.47 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  43.05 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.05 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.64 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.25 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  41.39 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.72 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.05 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  46.09 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  43.2 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  40.44 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  44.79 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  43.05 
 
 		 523 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  44.71 
 
 		 503 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  44.61 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  41.65 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  45.33 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 475 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  44 
 
 		 490 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  44.47 
 
 		 487 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  41.9 
 
 		 556 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  43.08 
 
 		 534 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  42.34 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  41 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  41.68 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  43.74 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.61 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  41.76 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  40.28 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  44.65 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  45.64 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.83 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  44.4 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  45.73 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  43.47 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.74 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  43.03 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  43.43 
 
 		 500 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  44.99 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  44.2 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  45.64 
 
 		 512 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  43.03 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  45.53 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  45.64 
 
 		 531 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  45.64 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  44.88 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  43.45 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.87 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  44.44 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  40.69 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  40.69 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  40.69 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  45.64 
 
 		 529 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  42.77 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  44.01 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  42.77 
 
 		 487 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  45.73 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  41.8 
 
 		 863 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  40.73 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  45.25 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  43.12 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  43 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  43.74 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  41.6 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  43 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  43.66 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  44.67 
 
 		 511 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  44.67 
 
 		 511 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  45.1 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  41.31 
 
 		 490 aa  363  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  40.87 
 
 		 864 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  45.08 
 
 		 511 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  45.49 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  45.29 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.8 
 
 		 486 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  43.29 
 
 		 485 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  41.26 
 
 		 490 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  45.05 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>