More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0984 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  100 
 
 		 390 aa  786    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  70.1 
 
 		 390 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  64.78 
 
 		 389 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  64.27 
 
 		 389 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  64.18 
 
 		 388 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  63.4 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  55.27 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  41.28 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  38.97 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  41.73 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  40.89 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  38.89 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  36.67 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  39.43 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  36.79 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  36.84 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  39.95 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  37.86 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  36.93 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  37.73 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  37.89 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  34.27 
 
 		 396 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  34.02 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  35.88 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  35.77 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  33.42 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  31.53 
 
 		 408 aa  199  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  33.51 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  33.51 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  32.89 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  32.05 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  31.06 
 
 		 398 aa  189  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  31.85 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  32.1 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  32.75 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  31.52 
 
 		 407 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  31.44 
 
 		 395 aa  183  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  31.15 
 
 		 397 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  33.96 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  31.41 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  33.51 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  32.25 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  29.26 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.5 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  29.37 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.47 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  27.36 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.72 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.72 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  27.76 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.35 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.73 
 
 		 367 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  30.51 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  27.72 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  28.65 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  27.66 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  29.78 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  28.5 
 
 		 356 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  29.43 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  29.48 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  29.46 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  25.13 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  25.13 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.27 
 
 		 354 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  29.1 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  29.1 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  29.1 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  29.1 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  29.1 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  29.48 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  27.57 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.38 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.38 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  26.25 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  26.49 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  25.88 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  33.09 
 
 		 348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  29.1 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  28.09 
 
 		 353 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  27.32 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.09 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  27.44 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.42 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  31.6 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  28.36 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.42 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  29.04 
 
 		 353 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  24.29 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  24.29 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.93 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  28.08 
 
 		 375 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  26.46 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  28.07 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  26.57 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>