More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1507 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 108 aa  215  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  91.67 
 
 		 108 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  67.92 
 
 		 109 aa  147  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  67.29 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  66.04 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  66.04 
 
 		 109 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  72.64 
 
 		 110 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  72.64 
 
 		 110 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  68.22 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  66.98 
 
 		 107 aa  140  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  66.98 
 
 		 107 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  66.98 
 
 		 107 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  66.98 
 
 		 107 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  66.98 
 
 		 107 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  66.98 
 
 		 107 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  66.98 
 
 		 107 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  75 
 
 		 109 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  66.04 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  68.18 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  68.18 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  68.18 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  68.18 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  68.18 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  68.18 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  68.18 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  61.32 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  60.19 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  59.77 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  60.75 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  60.92 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  58.62 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  56.76 
 
 		 111 aa  114  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  59.55 
 
 		 93 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  58.62 
 
 		 91 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  58.43 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  58.43 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  54.21 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  56.18 
 
 		 94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  54.21 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  53.33 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  54.35 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  58.97 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  48.84 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  45.92 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  53.09 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  56.58 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  45.54 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  51.14 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  55.26 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  45.1 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  55.26 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  43.93 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  55.26 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  46.15 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  46.15 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  43.93 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  49.43 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  48.28 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  43.4 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  44.94 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  47.19 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  47.57 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  49 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  44.04 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  47.47 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  54.88 
 
 		 105 aa  90.5  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  44.76 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  42 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  51.32 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  43.69 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  46.67 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  46.59 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  41.35 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  44.86 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  54.43 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  54.43 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  47.56 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  41.59 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 		 110 aa  83.6  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  51.22 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  40.38 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  42.45 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  39.09 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  51.9 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  42.31 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  51.9 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  51.9 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  49.4 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>