More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4522 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4522  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  51.35 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  50.67 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
942 aa  59.3  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
1087 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
1071 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
821 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
837 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  35.21 
 
 
833 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
730 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
730 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
838 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
800 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28495  copper-transporting P-type ATPase  34.29 
 
 
804 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105447  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
839 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
837 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
836 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
836 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
799 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  32.39 
 
 
806 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
798 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  34.62 
 
 
742 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  32.39 
 
 
806 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4626  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
754 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.617338  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
798 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  32.81 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
799 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
894 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
739 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
889 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
889 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  28.36 
 
 
750 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
826 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.89 
 
 
795 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55134  antioxidant and copper/iron homeostasis protein  43.94 
 
 
74 aa  48.9  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0743857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
797 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
754 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
1182 aa  48.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  29.58 
 
 
805 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
836 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  30.67 
 
 
802 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  30.67 
 
 
802 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
694 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
837 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
738 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
811 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
723 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
723 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 
857 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01481  putative P-type ATPase transporter for copper  33.78 
 
 
764 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
817 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01501  putative P-type ATPase transporter for copper  33.78 
 
 
764 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  38.81 
 
 
68 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
797 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  32.89 
 
 
757 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
798 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  35.38 
 
 
68 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
829 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  34.85 
 
 
74 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
814 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  29.58 
 
 
805 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
758 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
828 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  29.33 
 
 
807 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  28.21 
 
 
731 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  32.81 
 
 
805 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  32.81 
 
 
805 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  32.81 
 
 
805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
1061 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
712 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
1061 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  34.21 
 
 
1040 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
866 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  44.44 
 
 
792 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  32.81 
 
 
805 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
971 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
861 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  34.33 
 
 
1063 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
1061 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 
790 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  28.36 
 
 
871 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
1063 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  44.44 
 
 
792 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
826 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  39.39 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
806 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  32.81 
 
 
805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  34.33 
 
 
1061 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  41.33 
 
 
560 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
723 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
839 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  27.4 
 
 
954 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  32.89 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
818 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  27.27 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>