30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55134 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_55134  antioxidant and copper/iron homeostasis protein  100 
 
 		 74 aa  148  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0743857 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01390  iron/copper transporter Atx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08880)  57.35 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01230  copper chaperone, putative  45.95 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4522  heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 894 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 		 821 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 499 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 471 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 796 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  29.09 
 
 		 955 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  30.43 
 
 		 739 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  32.14 
 
 		 852 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 75 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31212  copper chaperone  29.23 
 
 		 71 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00208944  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 		 78 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  26.42 
 
 		 905 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  32.08 
 
 		 835 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 836 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 836 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  36.21 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 		 850 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.888341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  29.51 
 
 		 827 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 738 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 936 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  35.85 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 814 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  30.19 
 
 		 732 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 839 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>