117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3985 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  42 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  35.03 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  33.14 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  30.27 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  28.8 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.65 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.73 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  30.48 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  28.65 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  28.65 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.19 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.19 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  29.21 
 
 		 191 aa  99  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  27.57 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  28.96 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  28.11 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  29.19 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.73 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  32.61 
 
 		 189 aa  91.7  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  31.72 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  27.97 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  29.32 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  29.81 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  29.93 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  29.69 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.66 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  27.5 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  28.16 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  28.95 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.1 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  33.83 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  29.1 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  30.57 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  33.33 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  30.53 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  32.79 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.58 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  29.08 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  27.27 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  29.75 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3144  putative methyltransferase  26.06 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.875081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3283  putative methyltransferase  26.06 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  33.06 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  30.65 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  30.65 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  30.65 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  27.55 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  30.69 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  28.46 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1013  methyltransferase  26.06 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3294  putative methyltransferase  25.53 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.348454  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  24.74 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  24.74 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  28.46 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  28 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  24.23 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  32.59 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  34.27 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  34.27 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  25.22 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  26.09 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  24.74 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  24.74 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  30.22 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  28.1 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  25.41 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  31.17 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  26.88 
 
 		 281 aa  49.3  0.00004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  31.03 
 
 		 184 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0559  methyltransferase  32.93 
 
 		 314 aa  48.1  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000972435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0791  dimethyladenosine transferase  31.67 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0817  methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  28.43 
 
 		 298 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  33.33 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  32.62 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10161  dimethyladenosine transferase  23.26 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07111  dimethyladenosine transferase  33.01 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.139914 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  28.85 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  28.46 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  33.11 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  33.11 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  33.11 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  28.68 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  32.43 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>