48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3461 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 128 aa  264  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  67.9 
 
 		 209 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  44.19 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  34.58 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  37.21 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  31.53 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  38.37 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  38.37 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  37.97 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  35.65 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  35.65 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  35.44 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  33.91 
 
 		 216 aa  52  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  36.71 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  34.78 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  38.27 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  37.35 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  36.11 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  33.91 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  35.8 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  35.8 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  28.83 
 
 		 229 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  33.91 
 
 		 244 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  36.49 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  28.83 
 
 		 229 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  34.62 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  34.62 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  28.92 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  34.62 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  30 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  28 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  34.62 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  27.93 
 
 		 229 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  27.54 
 
 		 222 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  27.5 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  27.54 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  27.97 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  30.68 
 
 		 219 aa  42  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  39.13 
 
 		 212 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 193 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 191 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  27.27 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  29.55 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  30.68 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  28.99 
 
 		 202 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>