265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2949 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  77.7 
 
 
272 aa  428  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  77.21 
 
 
271 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  67.67 
 
 
280 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  65.77 
 
 
267 aa  363  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  67.18 
 
 
276 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  65.77 
 
 
271 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  61.13 
 
 
271 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  62.55 
 
 
284 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  59.76 
 
 
287 aa  316  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  59.84 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  58.96 
 
 
284 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 
257 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  52.77 
 
 
270 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  47.64 
 
 
273 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  46.3 
 
 
273 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 
273 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  50 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  46.56 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 
271 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  45.34 
 
 
266 aa  191  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
255 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  40.4 
 
 
264 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  40.96 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  38.49 
 
 
286 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 
270 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  36.93 
 
 
270 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  37.3 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
265 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 
288 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
265 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
265 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  35.8 
 
 
390 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  36.21 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  46.99 
 
 
176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  35.8 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 
275 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  38.37 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
275 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  33.33 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  22.56 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.15 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  21.35 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.78 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  21.52 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.03 
 
 
336 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  22.44 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.86 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  29.32 
 
 
292 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  23.63 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  35.61 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  23.93 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  21.28 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  21.85 
 
 
333 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.33 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  21.71 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  22.06 
 
 
301 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
283 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
312 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  22.06 
 
 
301 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  25.88 
 
 
259 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
286 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  22.06 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  22.06 
 
 
303 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 
257 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
260 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
270 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
270 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
284 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  21.71 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  21.35 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  22.73 
 
 
312 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  20.63 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  20.63 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>