More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1907 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 300 aa  610  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  53.26 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  52.92 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.89 
 
 		 302 aa  285  8e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.15 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.46 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  47.64 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.1 
 
 		 292 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.64 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  43.64 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.97 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  41.78 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  41.58 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  41.58 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  43.43 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  42.12 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  42.12 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  42.12 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  42.12 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  42.12 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  42.12 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  42.12 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.45 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.59 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  41.44 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.42 
 
 		 290 aa  198  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  36.75 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.67 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.25 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.52 
 
 		 282 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.72 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  41.87 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.38 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.42 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.49 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  39.1 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  36.18 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.75 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  39.1 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  38.41 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  40.84 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  43.4 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.84 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  39.56 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  41.76 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.99 
 
 		 288 aa  178  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  36.75 
 
 		 337 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.06 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  36.42 
 
 		 352 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.9 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  34.65 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.44 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  38.95 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  36.16 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  34.65 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  36.86 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  34.11 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  36.86 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  36.42 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.43 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.78 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  36.33 
 
 		 298 aa  171  9e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.87 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  39.18 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  36.18 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  36.18 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  36.18 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.11 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  38.27 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.04 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.87 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  38.31 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.87 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  38.31 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  36.96 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.87 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  38.31 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.2 
 
 		 354 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  37.94 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  33.98 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 354 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  37.36 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  37.17 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  39.18 
 
 		 342 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 350 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.46 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  38.46 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  37.64 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  38.06 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  35.15 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  37.27 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  37.27 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  37.27 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  37.27 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>