More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0664 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  244  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  56.41 
 
 		 120 aa  144  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  54.78 
 
 		 125 aa  143  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  57.26 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  38.33 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  38.04 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  47.19 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.66 
 
 		 468 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  36.44 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  41.25 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  32.32 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  38.55 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  38.55 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  38.55 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  36 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  39.29 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  33.06 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 321 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 480 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 554 aa  63.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.47 
 
 		 462 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  39.19 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 240 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 498 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  35.04 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.31 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 286 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  28.57 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  38.6 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.67 
 
 		 474 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>