141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0604 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  46.23 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  39.22 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  41.84 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  37.74 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  42.11 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  35.51 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  29.2 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  33.03 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.23 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  30.97 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  38.82 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  35.56 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  29.81 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2399  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.71543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  33 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  33.94 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  37.74 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  35.19 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  34.91 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  41.76 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  35.64 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  34.26 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  35.19 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  35.19 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  35.19 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  35.19 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  35.19 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  35.71 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  35.71 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  34.23 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  34.26 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  36.47 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  29.66 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  29.2 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  33.03 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  30.51 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.98 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  30.51 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  29.59 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  36.04 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  30.51 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2146  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164935  unclonable  0.0000011472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  26.05 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  34.44 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  30.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  29.13 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  34.26 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  30.7 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  31.43 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  31.43 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0001  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0001269  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  28.32 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  29.66 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  28.43 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  29.66 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  32.53 
 
 		 113 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  31.18 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  31.11 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  30.77 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  27.73 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  29.06 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  31 
 
 		 385 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  29 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  32.61 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  24.37 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  30.23 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  32.61 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  25.66 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  30.99 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  26.55 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  28.83 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  26.36 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  30.51 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  30.51 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  29.67 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  30.51 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  30.51 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  29.52 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  36.47 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  30.34 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  31.25 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  30.09 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  30.99 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>