24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0718 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 126 aa  253  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  40.87 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  38.02 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  42.11 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  47 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  37.93 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  38.26 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0357  hypothetical protein  40.3 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  29.06 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  34.62 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  33.33 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  30.37 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4203  ribonuclease P protein  35.44 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0154701  decreased coverage  0.00202105 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  45 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  36.99 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  26.12 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  27.69 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  31.43 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  33.33 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  32.91 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  31.65 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  34.21 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>