72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0097 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  100 
 
 		 138 aa  277  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  45.87 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  42.62 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  44.17 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  47 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  51.25 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  41.25 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  42.34 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  36.59 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  33.88 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  41.46 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  35.71 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  33.33 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  52.94 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  26.09 
 
 		 128 aa  48.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  38.83 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  44.9 
 
 		 118 aa  47.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2762  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000340802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  29.55 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  51.28 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  51.28 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  33.94 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  31.33 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  48.72 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  34.94 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  51.28 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  30.12 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  57.5 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  46.94 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  37.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  37.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  37.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  37.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  30.23 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  46.15 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  33.33 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  50 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  38.24 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  36.11 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  46.15 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  36.11 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  28.75 
 
 		 118 aa  42  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  36.11 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  36.11 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  35.79 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  35.8 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  34.57 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  35.71 
 
 		 133 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  36.62 
 
 		 120 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  30.77 
 
 		 129 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  30.38 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  45 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2146  ribonuclease P protein component  30.23 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164935  unclonable  0.0000011472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  38.57 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2826  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1786  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00873634  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  31.65 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  34.72 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 		 170 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>