79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0970 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  45.87 
 
 		 138 aa  90.1  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  41.18 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  38.02 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  44.66 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  36.52 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  37.19 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  46.25 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  33.61 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  34.78 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  34.69 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  41.77 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  30.28 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  28.05 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  31.87 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  28.05 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  32.43 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  32.43 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  31.65 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  44.74 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  36.78 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  28.21 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0134  ribonuclease P protein component  32.89 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0423414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  31.3 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  28.75 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2762  ribonuclease P protein component  28.87 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000340802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  30.38 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  29.37 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  25.61 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  28.1 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  26.45 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  23.75 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  34.57 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  30.38 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  29.11 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  30.38 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  30.38 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  30.38 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  29.11 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  29.11 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  29.11 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  29.11 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4016  ribonuclease P protein component  26.32 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116419  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  35.44 
 
 		 140 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0357  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  35.63 
 
 		 136 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  28.05 
 
 		 119 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4203  ribonuclease P protein  32.93 
 
 		 123 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0154701  decreased coverage  0.00202105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  28.21 
 
 		 120 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 118 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  35.29 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  32.31 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  40.54 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  44.74 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  31.94 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  30.36 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  27.71 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  50 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  30.68 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  27.85 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  25.77 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  42.11 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  39.47 
 
 		 108 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>