13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2523 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  100 
 
 		 136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  50 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  45.38 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  43.7 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  44.44 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  40.71 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  45.24 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  33.83 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  33.94 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  30.37 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  35.63 
 
 		 132 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  26.87 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>