14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2742 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  100 
 
 
146 aa  298  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  50 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  47.06 
 
 
136 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  44.27 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  38.71 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  38.39 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  43.53 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  30.95 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  38.83 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  27.69 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  32.93 
 
 
129 aa  40  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>