18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2337 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  50.76 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  45.38 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  44.27 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  47.32 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  41.46 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  46.15 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  31.91 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  33.88 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  30.28 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  31.25 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  41.98 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  26.12 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  27.59 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  40.3 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  40.3 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>