21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1544 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  40.62 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  36.29 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  42.62 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  38.26 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  32.79 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  46.25 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  32.77 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0357  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380253 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  40.51 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  30.08 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  41.98 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  40.74 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  33.33 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  35.92 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  36.25 
 
 		 118 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  36.96 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  28.69 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  32.52 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  35.24 
 
 		 140 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>