17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2131 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  100 
 
 		 122 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  48.39 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  44.44 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  38.71 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  41.46 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  43.9 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  34.21 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  39.47 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  36.99 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  30.39 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  30.59 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  29.06 
 
 		 123 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  42.55 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>