14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2563 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  100 
 
 		 118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  45.61 
 
 		 136 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  47.32 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  40.71 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  38.39 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  34.21 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  42.31 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  35.79 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  57.5 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  31.11 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  30.7 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2826  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>