15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2032 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  100 
 
 		 85 aa  170  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  45.24 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  46.15 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  43.53 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  43.9 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  42.31 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  44.3 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  52.94 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  46.43 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4016  ribonuclease P protein component  38.67 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116419  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  65.62 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  41.51 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  56.25 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  54.55 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  59.38 
 
 		 108 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>