40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03125 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  100 
 
 		 123 aa  249  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  40.87 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  42.34 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  34.17 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  35.45 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  31.91 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2742  ribonuclease P  30.95 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  32.77 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  27.84 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  34.38 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  44 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  44 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  50 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  50 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  30.53 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0357  hypothetical protein  47.92 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  40.38 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  30.17 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2032  ribonuclease P  41.51 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  40.38 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  45 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  43.86 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  42.86 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  45 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  48.65 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  40.82 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  29.06 
 
 		 122 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  35.62 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  41.67 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  30.7 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  26.87 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  51.52 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  39.13 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  45.65 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  38.33 
 
 		 120 aa  40  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>