19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3922 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3922  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  253  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220909  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3851  ribonuclease P protein component  53.12 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.747889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0097  RNase P protein, subunit A  42.62 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1544  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290862 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0718  ribonuclease P protein component  37.93 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  37.01 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  36.52 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03125  possible ribonuclease P component  34.17 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168885  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0357  hypothetical protein  41.67 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2337  ribonuclease P  31.25 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  32.67 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2563  ribonuclease P  40 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  34.02 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2131  ribonuclease P  30.39 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532091  normal  0.558429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4203  ribonuclease P protein  34.09 
 
 		 123 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0154701  decreased coverage  0.00202105 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2523  ribonuclease P  28.57 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  31.78 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  34.83 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>