36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0472 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  100 
 
 
561 aa  1131    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  31.05 
 
 
661 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.11 
 
 
581 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  39.26 
 
 
1296 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  37.35 
 
 
1001 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.16 
 
 
664 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  34.92 
 
 
474 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  31.93 
 
 
953 aa  222  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  28.6 
 
 
1172 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  30.13 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  25.44 
 
 
1627 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  27.74 
 
 
355 aa  123  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  25.08 
 
 
355 aa  101  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.68 
 
 
853 aa  50.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.75 
 
 
910 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.86 
 
 
858 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.97 
 
 
613 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.75 
 
 
915 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  30.77 
 
 
602 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  31.11 
 
 
777 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.12 
 
 
913 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
676 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.88 
 
 
913 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.71 
 
 
785 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  26.71 
 
 
881 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 
599 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  31.96 
 
 
883 aa  47.4  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 
606 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.24 
 
 
905 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.78 
 
 
711 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.87 
 
 
699 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.56 
 
 
526 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 
626 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.48 
 
 
530 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 
619 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 
797 aa  43.5  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>