More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2277 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  64.56 
 
 		 484 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  63.03 
 
 		 532 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  65.26 
 
 		 513 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  65.47 
 
 		 513 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2277  glycogen synthase  100 
 
 		 508 aa  1037    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.100037  hitchhiker  0.00503982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  63.66 
 
 		 528 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  65.2 
 
 		 519 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  63.99 
 
 		 519 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  65.2 
 
 		 519 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  64.99 
 
 		 519 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  63.08 
 
 		 497 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  57.44 
 
 		 512 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  54.24 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  55.74 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  55.96 
 
 		 509 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  51.61 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  51.61 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  53.05 
 
 		 510 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2800  glycogen synthase  54.75 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03376  glycogen synthase  54.27 
 
 		 509 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.28 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  42.44 
 
 		 480 aa  360  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.94 
 
 		 485 aa  359  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  41.96 
 
 		 478 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  40.92 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  40.5 
 
 		 477 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  41.54 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.54 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  41.54 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  41.54 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  41.54 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.89 
 
 		 496 aa  354  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  41.54 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  41.54 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  41.54 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  41.13 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  41.13 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  41.13 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  41.13 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  41.13 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  39.87 
 
 		 479 aa  353  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  42.2 
 
 		 477 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  41.13 
 
 		 477 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  40.95 
 
 		 501 aa  349  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  41.75 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  41.75 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.87 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  39.46 
 
 		 479 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  41.75 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  39.38 
 
 		 479 aa  342  7e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.39 
 
 		 489 aa  335  9e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.29 
 
 		 476 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  39.96 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.31 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  42.09 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  39.96 
 
 		 480 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.07 
 
 		 499 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.51 
 
 		 491 aa  324  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  41.89 
 
 		 486 aa  323  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.61 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  40.04 
 
 		 478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.48 
 
 		 508 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.1 
 
 		 485 aa  319  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.58 
 
 		 488 aa  317  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  39.43 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.65 
 
 		 498 aa  316  6e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  39.71 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  40.12 
 
 		 544 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.62 
 
 		 491 aa  313  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  39.67 
 
 		 489 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  39.79 
 
 		 486 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.2 
 
 		 549 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  37.2 
 
 		 493 aa  310  5e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.7 
 
 		 483 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  41.13 
 
 		 483 aa  309  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  39.59 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  39.46 
 
 		 478 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  39.26 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  39.26 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  37.76 
 
 		 487 aa  303  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  40.04 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.89 
 
 		 491 aa  300  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  39.96 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  39.96 
 
 		 533 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  37.97 
 
 		 543 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  37.97 
 
 		 543 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  39.36 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.66 
 
 		 478 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  37.89 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.95 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  36.63 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.26 
 
 		 500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.09 
 
 		 480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  37.24 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.48 
 
 		 486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.01 
 
 		 496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.34 
 
 		 480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.17 
 
 		 477 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.48 
 
 		 486 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>