48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0368 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  100 
 
 		 609 aa  1226    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  39.88 
 
 		 516 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  40.68 
 
 		 504 aa  343  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  39.8 
 
 		 502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  38.17 
 
 		 502 aa  333  4e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  40.13 
 
 		 552 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  38.12 
 
 		 502 aa  320  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  37 
 
 		 502 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  36.62 
 
 		 526 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  35.02 
 
 		 605 aa  296  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  36.48 
 
 		 537 aa  287  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  33 
 
 		 515 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  36.2 
 
 		 595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  35.99 
 
 		 600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  34.66 
 
 		 506 aa  257  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  32.58 
 
 		 746 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  34.5 
 
 		 496 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  32.52 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.17 
 
 		 482 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.12 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4126  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.59 
 
 		 514 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.74 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678758  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 447 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.32 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 443 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.44 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 447 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.32 
 
 		 471 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 465 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 		 448 aa  47.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3998  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.02 
 
 		 484 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.59 
 
 		 514 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.64 
 
 		 471 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0007  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.78 
 
 		 465 aa  47  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000120725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.17 
 
 		 495 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  24.65 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.02 
 
 		 495 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  24.73 
 
 		 501 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  29.73 
 
 		 454 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0822  outer membrane efflux family protein  27.23 
 
 		 472 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.67 
 
 		 495 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.99 
 
 		 495 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.99 
 
 		 495 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.99 
 
 		 495 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.18 
 
 		 482 aa  44.3  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0471  efflux ABC transporter outer membrane protein  22.8 
 
 		 484 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>