53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4031 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  43.79 
 
 		 847 aa  680    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1236  hypothetical protein  43.63 
 
 		 859 aa  658    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4031  hypothetical protein  100 
 
 		 802 aa  1642    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3326  hypothetical protein  48.12 
 
 		 800 aa  804    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000795061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1311  hypothetical protein  44.24 
 
 		 847 aa  680    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  42.41 
 
 		 859 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  41.42 
 
 		 764 aa  629  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  41.62 
 
 		 762 aa  628  1e-178  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  42.42 
 
 		 753 aa  612  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  36.94 
 
 		 734 aa  490  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2242  hypothetical protein  34.14 
 
 		 658 aa  228  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3193  hypothetical protein  32.57 
 
 		 653 aa  226  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2606  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1050 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3967  AAA ATPase  27.44 
 
 		 1046 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1184  ATPase  28.46 
 
 		 1071 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1144 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2632  ATPase  32.83 
 
 		 319 aa  95.1  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.57356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3423  AAA ATPase  29.01 
 
 		 1104 aa  95.1  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.598451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5089  AAA ATPase  28.3 
 
 		 1100 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0231758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  27.96 
 
 		 1076 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5149  AAA ATPase  26.84 
 
 		 1031 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120671  normal  0.52051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  26.6 
 
 		 1043 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2709  ATPase-like  23.89 
 
 		 1106 aa  64.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  22.62 
 
 		 563 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  28.78 
 
 		 544 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1724  ATPase  27.35 
 
 		 585 aa  51.6  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  27.13 
 
 		 523 aa  51.2  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0907  hypothetical protein  23.81 
 
 		 571 aa  50.4  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  32.47 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.49 
 
 		 593 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  37.33 
 
 		 570 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  28.68 
 
 		 523 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.37 
 
 		 623 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  25.9 
 
 		 564 aa  48.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.81 
 
 		 531 aa  48.1  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  39.34 
 
 		 499 aa  47.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  28.57 
 
 		 557 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  29.81 
 
 		 591 aa  47.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  23.77 
 
 		 497 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  26.11 
 
 		 526 aa  47.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  41.94 
 
 		 529 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  29.76 
 
 		 508 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  26.97 
 
 		 496 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  42.22 
 
 		 557 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  23.77 
 
 		 497 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  37.7 
 
 		 499 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  23.77 
 
 		 497 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  23.38 
 
 		 540 aa  46.2  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23.38 
 
 		 524 aa  45.8  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  29.87 
 
 		 559 aa  45.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  32.1 
 
 		 662 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  27.06 
 
 		 709 aa  44.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>