28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2663 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 702 aa  1470    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.638234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1036  AmoP  57.09 
 
 		 1882 aa  572  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.678372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3067  YD repeat protein  54.35 
 
 		 2003 aa  549  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1602  hypothetical protein  55.49 
 
 		 753 aa  535  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1600  hypothetical protein  50.81 
 
 		 607 aa  358  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1600 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.9 
 
 		 1464 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  22.62 
 
 		 1935 aa  55.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  22.25 
 
 		 722 aa  52  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  23.29 
 
 		 972 aa  52  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  26.91 
 
 		 765 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  22.25 
 
 		 2413 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 909 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  26.58 
 
 		 1681 aa  49.7  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  23.32 
 
 		 1732 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  26.3 
 
 		 2658 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  23.47 
 
 		 1938 aa  49.7  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.34 
 
 		 1599 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  26.03 
 
 		 1710 aa  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.07 
 
 		 3027 aa  47.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1854 aa  47.4  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.9 
 
 		 2096 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.81 
 
 		 2349 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  26.37 
 
 		 1991 aa  45.8  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  22.44 
 
 		 1352 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  22.79 
 
 		 740 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.24 
 
 		 1271 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  28.26 
 
 		 1147 aa  43.9  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>