160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1657 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1657  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 337 aa  687    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  32.8 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  30.06 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1010  Alpha/beta hydrolase  29.76 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292971  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  29.67 
 
 		 327 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  33.76 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  29.88 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  31.37 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  31.25 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  30.63 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  32.26 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 344 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  31.43 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.4 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  27 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  30.7 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  28.4 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  28.62 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  28 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  27.02 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13191  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  26.1 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0797843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  25.9 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  27.91 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.4 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13341  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  26.03 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.881706  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1241  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  26.44 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.488852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  27.22 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  27.15 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  27.15 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  27.15 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  27.15 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  29.7 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12181  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  30.16 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.642043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  27.15 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 345 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 345 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4611  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000220709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  30.38 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  28.03 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  27.18 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.48 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  27.36 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0383  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  26.16 
 
 		 340 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  29.75 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  25.83 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  26.16 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  25.83 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  26.16 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  26.16 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1973  hypothetical protein  30.77 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.862685  normal  0.265871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  27.46 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  26.16 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0034  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  25.9 
 
 		 386 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000016789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>