168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03978 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 344 aa  722    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  54.85 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  46.71 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  47.56 
 
 		 322 aa  295  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  44.27 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  46.01 
 
 		 335 aa  288  8e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  43.53 
 
 		 319 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  43.53 
 
 		 319 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  43.53 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  43.53 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  43.53 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  43.6 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  43.27 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  42.68 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  43.27 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  43.27 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  43.27 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  43.27 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  43.27 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  43.27 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  43.27 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  43.27 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  43.52 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  43.27 
 
 		 340 aa  275  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  41.85 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  41.16 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  41.07 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  44.09 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  43.04 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  41.59 
 
 		 327 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  42.9 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  42.9 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4576  putative hydrolase  43.52 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0617154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  42.9 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  41.59 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  42.01 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 		 323 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  44.55 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  44.9 
 
 		 334 aa  262  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  41.96 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  39.81 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  40.75 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  39.81 
 
 		 332 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  40.92 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  40.76 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  39.17 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  38.01 
 
 		 321 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  38.51 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  39.38 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 		 345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 		 345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 		 345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.75 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  37.27 
 
 		 345 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 345 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 345 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 342 aa  206  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 346 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  37 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.8 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  36.81 
 
 		 330 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  36.96 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  36.65 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  34.86 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  35.37 
 
 		 384 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  37.34 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  35.28 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  35.74 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  37.77 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  32.86 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  37.21 
 
 		 341 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>