163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002282 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 335 aa  697    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  90.75 
 
 		 335 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  70.86 
 
 		 329 aa  481  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  56.66 
 
 		 322 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  55.87 
 
 		 417 aa  364  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  56.29 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  54.89 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  57.46 
 
 		 334 aa  349  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  53.8 
 
 		 340 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  57.46 
 
 		 326 aa  347  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  57.46 
 
 		 326 aa  347  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  57.46 
 
 		 326 aa  347  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  54.24 
 
 		 340 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  53.03 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  53.03 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  53.03 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  53.5 
 
 		 340 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  53.19 
 
 		 340 aa  345  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  53.19 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  53.94 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  53.19 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  52.89 
 
 		 340 aa  343  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  54.32 
 
 		 319 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  54.32 
 
 		 319 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  54.32 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4576  putative hydrolase  56.47 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0617154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  57.55 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  46.01 
 
 		 344 aa  288  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  47.23 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  45.48 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  45.66 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  43.87 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  41.77 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 		 327 aa  262  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  45.51 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  45.83 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  43.69 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  45.19 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  43.23 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  44.08 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  42.99 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  41.64 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  44.41 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  40.8 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  42.58 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  43.73 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  41.49 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  41.3 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  40.06 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  40.06 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  40.06 
 
 		 330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  37.85 
 
 		 332 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  37.24 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  40.73 
 
 		 345 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  37.58 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  36.18 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.98 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  36.42 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  36.42 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  36.05 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0029  hypothetical protein  35.03 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00048077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  34.46 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0034  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  36.31 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000016789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  36.18 
 
 		 345 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  34.73 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  38.1 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 		 327 aa  185  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 332 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  37.92 
 
 		 371 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  39.12 
 
 		 358 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.06 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  37.41 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  37.07 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  37.07 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  37.07 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  37.07 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  37.07 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  37.07 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  37.07 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  35.87 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  31.94 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>