157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2137 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
325 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  55.35 
 
 
342 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  53.97 
 
 
318 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  54.6 
 
 
345 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  54.29 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  54.29 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  54.92 
 
 
345 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  53.21 
 
 
355 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  53.97 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  53.65 
 
 
345 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  53.65 
 
 
345 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  52.89 
 
 
337 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  51.65 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  54.32 
 
 
344 aa  309  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  52.78 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  53.25 
 
 
344 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  53.25 
 
 
344 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  54.28 
 
 
323 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  53.25 
 
 
344 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  53.25 
 
 
344 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  53.25 
 
 
344 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  53.25 
 
 
344 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  53.25 
 
 
344 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  54.61 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  54.78 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  54.46 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  50.91 
 
 
384 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  53.62 
 
 
348 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  51.38 
 
 
371 aa  294  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  52.35 
 
 
358 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  51.32 
 
 
326 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4836  alpha/beta hydrolase fold protein  54.11 
 
 
352 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  50.78 
 
 
358 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0261  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  50.16 
 
 
339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  51.38 
 
 
338 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0383  alpha/beta hydrolase fold  49.55 
 
 
354 aa  268  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  50.65 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  48.52 
 
 
321 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  47.89 
 
 
379 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  52.61 
 
 
387 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  44.73 
 
 
321 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 
321 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  43.69 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  43.75 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  41.19 
 
 
338 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  41.64 
 
 
323 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  40.69 
 
 
326 aa  235  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  47.51 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  40.81 
 
 
323 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  41.14 
 
 
327 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 
342 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
327 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  47.18 
 
 
329 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
347 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
327 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  40.51 
 
 
327 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 
347 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 
347 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  42.33 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  40.56 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  40.19 
 
 
347 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  42.02 
 
 
332 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  46.91 
 
 
356 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  40.92 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  39.75 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  42.24 
 
 
340 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  42.24 
 
 
340 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  42.24 
 
 
340 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  41.91 
 
 
340 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  42.24 
 
 
340 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  42.24 
 
 
340 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  42.24 
 
 
340 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  42.24 
 
 
340 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  41.91 
 
 
340 aa  215  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  43.79 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 
330 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  39.74 
 
 
330 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  43.43 
 
 
325 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  41.58 
 
 
319 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  41.58 
 
 
319 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  41.58 
 
 
340 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  41.58 
 
 
340 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  44.41 
 
 
342 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  41.25 
 
 
319 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  40.45 
 
 
344 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  37.98 
 
 
360 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
321 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  40.58 
 
 
337 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  41.89 
 
 
330 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  46.84 
 
 
334 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  37.95 
 
 
417 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  38.66 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  36.94 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  35.85 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  36.79 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  38.51 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  39.6 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>