157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0426 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
328 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  65.15 
 
 
334 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  65.15 
 
 
334 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0383  alpha/beta hydrolase fold  64.76 
 
 
354 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  62.81 
 
 
338 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  59.01 
 
 
326 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  59.94 
 
 
323 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  59.75 
 
 
348 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4836  alpha/beta hydrolase fold protein  62.96 
 
 
352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  60.12 
 
 
341 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0261  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  59.88 
 
 
339 aa  352  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  49.87 
 
 
387 aa  338  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  55.45 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  55.45 
 
 
345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  54.32 
 
 
318 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  55.13 
 
 
345 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  58.25 
 
 
355 aa  322  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  57.19 
 
 
379 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  55.45 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 
345 aa  315  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  54.81 
 
 
345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  54.49 
 
 
345 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  54.49 
 
 
345 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  55.11 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  55.11 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  55.11 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  55.11 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  55.11 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  55.11 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  55.11 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  53.21 
 
 
372 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  53.87 
 
 
344 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  51.65 
 
 
384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  51.82 
 
 
337 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  52.13 
 
 
358 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  51.52 
 
 
358 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  54.72 
 
 
371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  46.53 
 
 
342 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  50.65 
 
 
325 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  42.67 
 
 
340 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  42.67 
 
 
340 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  42.67 
 
 
340 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  42.67 
 
 
340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  41.5 
 
 
340 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  42.67 
 
 
340 aa  216  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  42.35 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  42.35 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  42.35 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  41.56 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  41.96 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  41.56 
 
 
340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  40.54 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  44.66 
 
 
332 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  41.08 
 
 
330 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  44.66 
 
 
329 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 
332 aa  208  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  41.39 
 
 
319 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  41.39 
 
 
319 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  40.85 
 
 
340 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
321 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 
330 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  41.06 
 
 
319 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  38.34 
 
 
417 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  41.85 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.48 
 
 
334 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 
323 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  38.97 
 
 
329 aa  192  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  39.23 
 
 
325 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  35.15 
 
 
322 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  38.02 
 
 
335 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  38.34 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  37.99 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  41.99 
 
 
342 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 
353 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  36.98 
 
 
327 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
338 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  40 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  36.33 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  39.03 
 
 
323 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
327 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  36.01 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  42.39 
 
 
326 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 
327 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  42.39 
 
 
326 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  42.39 
 
 
326 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0029  hypothetical protein  33.33 
 
 
350 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00048077  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0034  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  36.09 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000016789  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  41.83 
 
 
331 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
342 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  42.38 
 
 
330 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 
321 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
347 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
347 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  36.64 
 
 
330 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  36.58 
 
 
324 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 
324 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>