176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5117 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
330 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  94.53 
 
 
330 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  98.18 
 
 
330 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  85.71 
 
 
330 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  72.62 
 
 
344 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  72.7 
 
 
337 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  74.09 
 
 
332 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  70.99 
 
 
332 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  75.47 
 
 
327 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  71.56 
 
 
332 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  70.37 
 
 
329 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  46.5 
 
 
327 aa  281  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  45.59 
 
 
327 aa  278  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  45.2 
 
 
323 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  46.22 
 
 
325 aa  276  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 
326 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  45.06 
 
 
327 aa  264  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  45.06 
 
 
327 aa  262  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  44.75 
 
 
327 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  44.27 
 
 
327 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 
323 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  45.06 
 
 
347 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  45.06 
 
 
347 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 
347 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  46.89 
 
 
332 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  44.75 
 
 
347 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  43.33 
 
 
330 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 
327 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  43.79 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  45.2 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  43.48 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  43.85 
 
 
319 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  43.85 
 
 
319 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  43.85 
 
 
319 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  43.29 
 
 
340 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  44.38 
 
 
338 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  43.03 
 
 
342 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  42.99 
 
 
417 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  43.38 
 
 
340 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  42.99 
 
 
340 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  42.99 
 
 
340 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  42.68 
 
 
340 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  42.99 
 
 
340 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  42.99 
 
 
340 aa  248  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  42.99 
 
 
340 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 
323 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  42.99 
 
 
340 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  40.75 
 
 
344 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  42.38 
 
 
340 aa  245  6.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  42.77 
 
 
329 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  46.27 
 
 
326 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  46.27 
 
 
326 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  46.27 
 
 
326 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 
330 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4576  putative hydrolase  44.72 
 
 
326 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0617154  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  39.2 
 
 
322 aa  229  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  37.95 
 
 
353 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  42.68 
 
 
334 aa  225  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  43.69 
 
 
331 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  40.43 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  40.06 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  40.19 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  41.36 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  41.19 
 
 
329 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  42.24 
 
 
327 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 
342 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.74 
 
 
325 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  41.33 
 
 
345 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  41.74 
 
 
334 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  38.05 
 
 
326 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  37.93 
 
 
326 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 
321 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  38.86 
 
 
330 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  36.88 
 
 
320 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  38.04 
 
 
326 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  42.42 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  39.69 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 
321 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  38.17 
 
 
321 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  39.65 
 
 
355 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  38.98 
 
 
324 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  37.8 
 
 
323 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  40.83 
 
 
358 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 
358 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  39.68 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.38 
 
 
318 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  37.78 
 
 
345 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  36.83 
 
 
345 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  36.83 
 
 
345 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  37.42 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  37.46 
 
 
372 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  34.08 
 
 
324 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
334 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  38.72 
 
 
344 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 
334 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
345 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
345 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>