156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0318 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
334 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  99.1 
 
 
334 aa  653    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0383  alpha/beta hydrolase fold  77.38 
 
 
354 aa  471  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0261  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  67.06 
 
 
339 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  70.03 
 
 
338 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4836  alpha/beta hydrolase fold protein  70.39 
 
 
352 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  63.47 
 
 
379 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  64.78 
 
 
328 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  64.05 
 
 
323 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  64.35 
 
 
348 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  64 
 
 
341 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  60.74 
 
 
326 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  68.95 
 
 
387 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  56.88 
 
 
318 aa  339  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  57.7 
 
 
345 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  58.28 
 
 
355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  52.35 
 
 
372 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  56.15 
 
 
345 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  56.67 
 
 
337 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 
345 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 
345 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  57.23 
 
 
344 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  58.07 
 
 
344 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  58.07 
 
 
344 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  58.07 
 
 
344 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  58.07 
 
 
344 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  58.07 
 
 
344 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  58.07 
 
 
344 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  56.78 
 
 
345 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  56.83 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  55.84 
 
 
346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  57.28 
 
 
358 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  55.76 
 
 
358 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  50.29 
 
 
384 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  55.21 
 
 
345 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  52.13 
 
 
342 aa  323  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  55.21 
 
 
345 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  57.32 
 
 
371 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  55.1 
 
 
325 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  43.38 
 
 
321 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
321 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  45.48 
 
 
332 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  43.89 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  45.48 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  39.43 
 
 
327 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  42.39 
 
 
326 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  38.92 
 
 
327 aa  208  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  38.92 
 
 
327 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  38.92 
 
 
327 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  40.94 
 
 
340 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  41.25 
 
 
340 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  41.25 
 
 
340 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  41.25 
 
 
340 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  40.94 
 
 
340 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  40.94 
 
 
340 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  40.94 
 
 
340 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  40.94 
 
 
340 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  38.34 
 
 
342 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  40.94 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  40.25 
 
 
325 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 
332 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  43.67 
 
 
356 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  37.66 
 
 
327 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 
324 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  44.84 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 
323 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  36.68 
 
 
338 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  40.85 
 
 
321 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
347 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
347 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
347 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  38.81 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  39.62 
 
 
417 aa  195  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  38.81 
 
 
332 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  42.9 
 
 
340 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  42.9 
 
 
319 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  42.9 
 
 
340 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  42.9 
 
 
319 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 
330 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  37.26 
 
 
347 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  42.57 
 
 
319 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  45.81 
 
 
334 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
323 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  36.01 
 
 
350 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  42 
 
 
340 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 
353 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0029  hypothetical protein  36.27 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00048077  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  37.58 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  45.2 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  33.15 
 
 
360 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
330 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  42.91 
 
 
334 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  35.64 
 
 
327 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  37.13 
 
 
324 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  35.29 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  34.92 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>