158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1531 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  59.38 
 
 
330 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  57.63 
 
 
325 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  51.7 
 
 
321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  52.1 
 
 
324 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  46.3 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  50.32 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  48.66 
 
 
332 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  40.99 
 
 
324 aa  266  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  41.46 
 
 
360 aa  265  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  41.25 
 
 
312 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
356 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  43.35 
 
 
332 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  38.32 
 
 
323 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  43.89 
 
 
329 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.25 
 
 
318 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4611  alpha/beta hydrolase fold  37.73 
 
 
327 aa  230  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000220709  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  39.81 
 
 
371 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  39.63 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  39.75 
 
 
358 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  39.43 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.97 
 
 
334 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  42.39 
 
 
334 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
355 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  42.39 
 
 
334 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  38.56 
 
 
332 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  37.84 
 
 
332 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 
332 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 
345 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 
345 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
345 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0383  alpha/beta hydrolase fold  41.45 
 
 
354 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
346 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  38.75 
 
 
344 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  38.75 
 
 
344 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  39.06 
 
 
344 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  38.75 
 
 
344 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  38.89 
 
 
338 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  38.75 
 
 
344 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  38.75 
 
 
344 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  38.75 
 
 
344 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  38.75 
 
 
344 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  38.8 
 
 
345 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
330 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  37.07 
 
 
337 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
327 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  39 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  37.94 
 
 
321 aa  198  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  35.38 
 
 
372 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.6 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  37.93 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  37.99 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  37.42 
 
 
323 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  36.79 
 
 
337 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  37.62 
 
 
326 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  36.94 
 
 
344 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  34.14 
 
 
384 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  37.9 
 
 
325 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 
330 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  37.18 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  37.67 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0261  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  36.86 
 
 
339 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
344 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
347 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  37.33 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  36.57 
 
 
329 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
347 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  37.75 
 
 
348 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  37.33 
 
 
340 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  36.99 
 
 
340 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  36.99 
 
 
340 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  34.37 
 
 
327 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  36.99 
 
 
340 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  36.99 
 
 
340 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  34.06 
 
 
327 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 
323 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  36.31 
 
 
326 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  35.6 
 
 
417 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
321 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 
327 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  35.92 
 
 
321 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  36.64 
 
 
340 aa  186  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  37.42 
 
 
347 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  35.24 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  35.69 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  35.96 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  35 
 
 
379 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
342 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  40.67 
 
 
329 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
353 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>