159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0296 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  100 
 
 
322 aa  674    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  60.82 
 
 
329 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  56.97 
 
 
335 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  56.66 
 
 
335 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  54.69 
 
 
340 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  54.37 
 
 
340 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  54.37 
 
 
340 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  54.37 
 
 
340 aa  359  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  54.37 
 
 
340 aa  359  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  54.37 
 
 
340 aa  359  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  54.37 
 
 
340 aa  358  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  54.37 
 
 
340 aa  358  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  54.37 
 
 
340 aa  358  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  53.61 
 
 
417 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  54.09 
 
 
340 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  54.09 
 
 
340 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  52.7 
 
 
330 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  54.14 
 
 
319 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  53.16 
 
 
340 aa  345  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  54.14 
 
 
319 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  54.14 
 
 
319 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4576  putative hydrolase  55.17 
 
 
326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0617154  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  54.55 
 
 
334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  54.8 
 
 
326 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  54.8 
 
 
326 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  54.8 
 
 
326 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  55.24 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  47.56 
 
 
344 aa  295  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  44.27 
 
 
353 aa  268  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  44.62 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  45.78 
 
 
342 aa  265  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  43.83 
 
 
325 aa  265  8e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  44.34 
 
 
347 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  44.03 
 
 
347 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  44.51 
 
 
342 aa  259  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  44.03 
 
 
347 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  42.77 
 
 
327 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  44.03 
 
 
347 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  42.9 
 
 
327 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  43.08 
 
 
327 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  42.77 
 
 
327 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  42.63 
 
 
327 aa  255  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  41.19 
 
 
323 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  41.85 
 
 
323 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  41.23 
 
 
338 aa  248  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
321 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  41.01 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  38.99 
 
 
323 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  39.2 
 
 
330 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  39.2 
 
 
330 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  41.14 
 
 
332 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
330 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  38.01 
 
 
344 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  38.04 
 
 
337 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  37.15 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  37.15 
 
 
332 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
345 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  39.01 
 
 
330 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
330 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 
355 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  37.96 
 
 
329 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 
345 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  36.71 
 
 
372 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
342 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  36.77 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 
332 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  37.58 
 
 
332 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
345 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
345 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.31 
 
 
325 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  35.09 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 
327 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  35.92 
 
 
345 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.58 
 
 
318 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  36.95 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  37.3 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
358 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  37.34 
 
 
344 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  36.45 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  36.45 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  36.45 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  36.45 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  36.45 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  36.45 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  36.45 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  35.24 
 
 
320 aa  182  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  35.15 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  34.59 
 
 
338 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 
356 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
321 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  32.06 
 
 
321 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  31.72 
 
 
326 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>