166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4755 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 344 aa  708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  89.16 
 
 		 337 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  72.92 
 
 		 330 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  72.62 
 
 		 330 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  72.76 
 
 		 330 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  76.62 
 
 		 332 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  74.69 
 
 		 330 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  71.03 
 
 		 332 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  71.65 
 
 		 332 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  74.45 
 
 		 327 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  71.12 
 
 		 329 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  47.83 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  45.09 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  44.79 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  45.09 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  44.79 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  43.9 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  43.34 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  44.48 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  44.17 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 		 323 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  42.69 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  43.41 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  44.34 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  42.43 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  42.43 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 		 323 aa  248  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  42.3 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  43.65 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  42.94 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  42.94 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  42.94 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  42.37 
 
 		 417 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  41.69 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  41.69 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  41.69 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  41.69 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  41.69 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  41.69 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  41.69 
 
 		 340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  41.39 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  44.07 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  44.07 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  44.07 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  41.54 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  41.49 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  41.25 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4576  putative hydrolase  44.41 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0617154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  38.01 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  42.27 
 
 		 342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  42.37 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  43.93 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  42.94 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  40.12 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  41.83 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  38.17 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.45 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  41.28 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.03 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  36.94 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.57 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  38.85 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  37.69 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  37.46 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  38.39 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  36.83 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 321 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  36.19 
 
 		 321 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  37.81 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  40 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 323 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  38.59 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  36.36 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>