162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1008 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 325 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  63.5 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  57.01 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  50.91 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  51.8 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  49.22 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  48.64 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  44.24 
 
 		 320 aa  277  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  41.41 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  39.94 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  45.11 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  36.96 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4611  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000220709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  39.94 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  38.44 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  42.38 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  38.64 
 
 		 371 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.24 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.43 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 346 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  38.2 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 		 321 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  37.92 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  37.96 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  39.54 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  37.96 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  37.96 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  37.96 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  37.96 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  37.96 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  38.01 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  40.13 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  37.96 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  38.78 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  40.13 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.9 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  39.49 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  38.87 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  38.87 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  38.61 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  38.05 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  37.18 
 
 		 384 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  37.99 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  35.78 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  36.84 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  37.92 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  35.98 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  34.43 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  34.1 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  34.1 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  34.1 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  34.1 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  34.1 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  33.77 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  32.69 
 
 		 417 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  34.25 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  37.17 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  35.03 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  35.03 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  33.44 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  35.03 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  34.36 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  35.37 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  35.03 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  33.64 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  37.54 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  37.2 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  33.65 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  34.08 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  34.08 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  34.08 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  35.65 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>