161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1075 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
360 aa  749    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  46.65 
 
 
321 aa  302  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  42.06 
 
 
324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
323 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  42.58 
 
 
330 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  40.5 
 
 
320 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  40.62 
 
 
326 aa  255  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  40.29 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 
325 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  36.18 
 
 
312 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  38.89 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 
345 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 
345 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 
321 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
345 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  38.72 
 
 
345 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
346 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 
355 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  36.16 
 
 
372 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  35.98 
 
 
384 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  36.34 
 
 
342 aa  205  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4611  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 
327 aa  205  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000220709  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
332 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
345 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.98 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 
358 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  35.09 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
356 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
327 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  34.76 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  35.12 
 
 
330 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  35.33 
 
 
344 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  35.03 
 
 
344 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  35.03 
 
 
344 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  35.03 
 
 
344 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  35.03 
 
 
344 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  35.03 
 
 
344 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  35.03 
 
 
344 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  35.03 
 
 
344 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.96 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  33.05 
 
 
417 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  34.36 
 
 
327 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 
347 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 
347 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
326 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
323 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
347 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 
347 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  36.13 
 
 
325 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 
329 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 
342 aa  179  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  32.33 
 
 
387 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  33.33 
 
 
335 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  33.7 
 
 
327 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  33.33 
 
 
340 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  33.98 
 
 
340 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  33.61 
 
 
340 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 
323 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  33.98 
 
 
340 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  33.33 
 
 
340 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  32.96 
 
 
327 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  33.43 
 
 
338 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  34 
 
 
340 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
340 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  34 
 
 
340 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  32.74 
 
 
335 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0261  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  32.84 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  32.84 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  33.52 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  33.15 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  35.22 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  35.22 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  35.22 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  34.81 
 
 
344 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  33.62 
 
 
319 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
338 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  34.58 
 
 
337 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4836  alpha/beta hydrolase fold protein  35.47 
 
 
352 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  31.87 
 
 
348 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  31.23 
 
 
323 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  33.43 
 
 
319 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  33.43 
 
 
319 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4576  putative hydrolase  34.84 
 
 
326 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0617154  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
328 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  33.14 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  34.6 
 
 
330 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  33.14 
 
 
340 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  30.93 
 
 
341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  32.26 
 
 
329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>