164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1973 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1973  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  669    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.862685  normal  0.265871 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0687  hypothetical protein  75.67 
 
 
341 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.393434  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08631  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  66.11 
 
 
370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12181  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  50.56 
 
 
364 aa  342  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.642043 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0752  alpha/beta fold family hydrolase  51.69 
 
 
360 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15921  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  51.43 
 
 
366 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1241  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  41.28 
 
 
362 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.488852  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13191  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  40.59 
 
 
360 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0797843  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13341  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  40.99 
 
 
362 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.881706  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13091  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  41.45 
 
 
355 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
327 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  33.72 
 
 
344 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
327 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
327 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1657  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
337 aa  99.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  36.36 
 
 
332 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
330 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  36.08 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  32.94 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 
330 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  35.63 
 
 
348 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
347 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
326 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  30.95 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
332 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  29.67 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  32.15 
 
 
325 aa  92.4  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
347 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  29.35 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  32.67 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  29.53 
 
 
335 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  27.89 
 
 
350 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  32.47 
 
 
342 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  29.89 
 
 
335 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  31.66 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0029  hypothetical protein  28.92 
 
 
350 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00048077  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
323 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  30.65 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  31.1 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
324 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0582  hypothetical protein  30.94 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00195115  normal  0.0344237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  33.73 
 
 
387 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  30.69 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  31.66 
 
 
340 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  30.69 
 
 
340 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  31.82 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  31.82 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  30.85 
 
 
319 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  30.85 
 
 
319 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  32.01 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  30.85 
 
 
319 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  32.14 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  31.78 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  27.54 
 
 
322 aa  85.9  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  32.14 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
334 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  32.99 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  32.68 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  29.96 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  31.43 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  31.75 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  32.93 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  32.93 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  32.93 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  31.08 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  31.85 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  29.5 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  29.52 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  29.5 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  31.3 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0261  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  33.86 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  30.65 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1653  alpha/beta hydrolase  26.22 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0172  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.34441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>