160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0687 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0687  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  677    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.393434  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1973  hypothetical protein  75.67 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.862685  normal  0.265871 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08631  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  65.46 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12181  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  51.4 
 
 
364 aa  358  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.642043 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15921  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  51.27 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0752  alpha/beta fold family hydrolase  50.99 
 
 
360 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13091  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  42.32 
 
 
355 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13191  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  41.28 
 
 
360 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0797843  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1241  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  42.61 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.488852  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13341  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  41.16 
 
 
362 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.881706  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
323 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
353 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  35.11 
 
 
344 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
327 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  34.49 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
327 aa  99.4  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  31.52 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
324 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1657  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  34.23 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 
332 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  31.97 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  31.29 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  33.97 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  33.85 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  29.66 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  29.41 
 
 
324 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  30.31 
 
 
417 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  30.89 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  28.03 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  29.66 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
345 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  29.57 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
323 aa  86.3  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  28.63 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  29.97 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  29.86 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  29.97 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  29.1 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  29.97 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  29.97 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  32.55 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  29.97 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
323 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  29.51 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  29.51 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  26.41 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  29.51 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  29.51 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  29.27 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  31.1 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  29.51 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  32.55 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  29.51 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  33.77 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  29.05 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0582  hypothetical protein  30.26 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00195115  normal  0.0344237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  30.12 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  34.33 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  34.33 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  34.33 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  25.91 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  28.28 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0029  hypothetical protein  26.48 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00048077  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  31.64 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  30.5 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.42 
 
 
318 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06555  hydrolase, alpha/beta fold family, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04640)  25.71 
 
 
471 aa  75.9  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  27.1 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  31.87 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  29.97 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1653  alpha/beta hydrolase  25.65 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>